O Mosteiro de Santa Clara a Nova foi construído em 1649 na mrgem esquerda do Rio Mondego, destinado a acolher as Clarissas do Convento de Santa Clara a Nova, de acordo com o plano do engenheiro-mor do reino e professor da Universidade de Coimbra, Frei João Torriano.
Em 1677, numa grande procissão a partir do antigo Convento, fes-ze a trasladação do corpo da Rainha Santa Isabel, tendo sido colocado num túmulo de prata no altar-mor.
A Igreja, por sua vez, foi construída pelo arquitecto Mateus do Couto. Na grande ábside que forma a cabeceira, encontra-se a estátua policroma de Santa Isabel, da autoria de Teixeira Lopes (séc. XIX).
De notar a talha dourada barroca e as telas alusivas à vida da Rainha Santa, do séc. XVIII. Dois belos túmulos góticos da Oficina de Coimbra guardam os restos mortais da Infanta D. Isabel, filha do rei D. Afonso IV, e a filha do regente e Duque de Coimbra D. Pedro.
De referir ainda as alfaias de prata, o cadeiral com 78 cadeiras, da primeira metade do séc. XVIII e os retábulos vindos de Santa Clara a Velha, de talha e pinturas maneiristas.
No claustro barroco, riscado pelo arquitecto Carlos Mardel, está instalado o Museu Militar.