Inaugurado em 1898 sob o patrocínio do rei D.Carlos I (1863-1908), o principal objetivo deste museu e aquário consiste em proporcionar ao visitante um contacto direto com a riqueza do meio aquático. O museu encerra uma coleção muito diversificada de objetos relacionados com as explorações oceanográficas efectuadas por D. Carlos.

O aquário possui 4.000 espécimes da fauna e flora marinhas dos diversos ecossistemas do globo.